胡塞武装组织属于什叶派分支中的宰德派，而目前这个教派在全世界范围内几乎仅存在于也门。宰德派在很多方面都与逊尼派较接近，属于什叶派中的温和派。
也门胡赛武装控制区域也门是个传统的伊斯兰教国家，有着浓厚的伊斯兰宗教氛围。尽管什叶派在也门并非多数，但是宰德派的什叶派团体却具有一定影响力。也门西北部是宰德派的中心，那里有多个宰德派部落，人口超过万。
长期以来，宰德派在也门一直处于政治统治地位，并经常打击逊尼派的部落。然而，这种情况在年后出现了逆转，由于当年也门共和政府取代了宰德派的政权，宰德派势力被迫退回也门北部山区。此后，也门政府长期对宰德派在政治、经济上采取边缘化政策，导致该派所在的萨达省等地方的经济发展迟缓、落后，人民生活贫困不堪。此时，沙特阿拉伯最大的逊尼派派别一一瓦哈比派对也门的宗教渗透与影响日益增大，在也门政界也拥有相当大的话语权，对也门政坛具有重要影响力。在此情势下，也门境内包括“基地”组织在内的逊尼派力量不断发展壮大，使本属少数派的宰德派日感生存空间遭受挤压，政治地位每况愈下，不断上升的危机感促使部分宰德派人士开始推动宰德派复兴运动。来自萨达省的宰德派宗教人士巴达尔丁胡塞开始推动宰德派复兴运动，并成立了包括胡塞武装组织的前身——青年信仰者组织。
巴达尔丁胡塞年也门联合政府时期，在巴达尔丁胡塞领导的宰德派复兴运动推动下，隶属宰德派的真理党和青年信仰者组织得到了进一步发展，而巴达尔丁胡塞的儿子侯赛因胡塞则被选举为也门议会议员，该组织借机积极参与也门政治事务。当时，也门政府对隶属什叶派分支的宰德派则在政治和经济上采取压制和边缘化政策，这引起了宰德派的强烈不满。
年美国入侵伊拉克后，该组织发起大规模示威，反对萨利赫的亲美政策。宰德派的青年信仰者组织举起了反美、反以大旗，其成员在清真寺举行反美、反以的集会，指责也门政府追随美国的反恐政策。也门政府对此予以严厉打击和镇压，将许多青年信仰者组织的支持者投入大牢。
年，萨利赫总统邀请侯赛因胡塞到萨那会谈，遭到后者拒绝，也门政府随即派军警逮捕胡塞，胡塞则就此发动叛乱，由此揭开也门胡塞武装组织与也门政府之间无休止的武装冲突。当年6~8月，也门政府军在北部打击胡塞武装组织的行动中，导致-人丧生。
也门胡赛武装9月10日，也门政府军在一次军事行动中将侯赛因胡塞击毙。此后，侯赛因胡塞的支持者将青年信仰者组织改称“胡塞人”（即胡塞武装组织），以示其将永远追随侯赛因胡塞的决心与意志。胡塞武装组织改由侯赛因胡塞的兄弟们共同领导，其中最有影响力的头目当属阿卜杜拉马立克胡塞。而侯赛因胡塞的父亲巴达尔丁胡塞则成为胡塞武装组织的精神领袖。
也门胡赛武装据报道，胡塞武装得到了同为什叶派的伊朗的重要支持，伊朗不仅为其提供资金和武器弹药方面的援助，甚至派出军事顾问，在训练和作战等方面为其提供指导。
胡赛武装的导弹胡塞武装组织坚称其对抗政府是为使宰德派免受歧视和侵略，并称也门政府正与包括“基地”组织和沙特政府在内的逊尼派力量一起打击什叶派。而也门政府则指责其企图在也门重建宰德派政权，推行什叶派宗教法律、渲染反美情绪，并指责什叶派大国伊朗等外部力量支持胡赛武装组织。
胡赛武装击落沙特无人机年4月2日，也门总统哈迪呼吁伊朗“对也门收手，停止对胡赛武装组织支持”。对此，伊朗政府则予以否认。由此可见，宗教意识之争是也门政府与胡赛武装组织冲突的重要原因。